Tout le monde connaît l'histoire de Roméo Montaigu et de Juliette Capulet, et bien découvrez maintenant l'histoire fascinante de Gennosuke du Clan Koga et Oboro du Clan Iga, deux famille de Ninjas qui se haissent et qu'une lutte de pouvoir va autoriser à s'entretuer.
Les deux amants sont alors séparés par une lutte sans merci où les ninjas des deux clans vont faire valoir leurs techniques meurtrières et leurs capacités à la manipulation. C'est une guerre où le dernier survivant décidera du successeur au pouvoir, et donc Gennosuke et Oboro n'auront d'autre choix que de s'affronter, à moins que…